Премьер-министр Бурунди являлся до 1998 года главой правительства. Премьер-министра назначал президент или им становился и сам глава государства. После принятия в 1998 году временной конституции пост премьер-министра был упразднён. Отныне функции главы правительства исполняет президент страны.

Список премьер-министров

• Жозеф Симпайе (26 января 1961 - 28 сентября 1961)
• Луи Рвагасоре (хуту) (28 сентября 1961 - 13 октября 1961)
• Андре Мухирва (20 октября 1961 - 10 июня 1963)
• Пьер Нгендандумве (хуту) (18 июня 1963 - 6 апреля 1964)
• Альбин Ньямойя (хуту) (6 апреля 1964 - 7 января 1965)
• Пьер Нгендандумве (хуту) (7 января 1965 - 15 января 1965)

(и.о.) Пье Масумбуко (15 января 1965 - 26 января 1965)

• Жозеф Бамина (хуту) (26 января 1965 - 30 сентября 1965)
• Леопольд Биха (тутси) (13 октября 1965 - 8 июля 1966)
• Мишель Мичомберо (тутси) (11 июля 1966 - 15 июля 1972)
• Альбин Ньямойя (хуту) (15 июля 1972 - 5 июня 1973)
• Эдуард Нзамбимана (12 ноября 1976 - 13 октября 1978)

Должность премьер-министра упразднена

• Андриен Сибомана (хуту) (19 октября 1988 - 10 июля 1993)
• Сильви Киниги (тутси) (10 июля 1993 - 7 февраля 1994)
• Анатоль Каньенкико (тутси) (7 февраля 1994 - 22 февраля 1995)
• Антуан Ндувайо (тутси) (22 февраля 1995 - 31 июля 1996)
• Паскаль-Ферме Ндимира (хуту) (31 июля 1996 - 12 июня 1998)

Должность премьер-министра упразднена