Гем Б (также известный как протогем IX) наиболее часто встречающийся гем, как в гемоглобине, так и в миоглобине. Такое семейство ферментов как пероксидазы тоже содержат в себе гем Б. Циклогеназа-1 и циклогеназа-2 из малоизвестного семейства семейства циклогеназ содержат в себе гем Б как один из своих активных сайтов.

Обычно гем Б крепится к окружающему его белковому матриксу (апоэнзим) посредством координационной связи между железом гема и аминокислотой боковой цепи. Гемоглобин и миоглобин связываются с гемом через гистидин, а синтаза оксида азота и Цитохром P450 через цистеин.

Поскольку железо в гем-содержащих белках связано с четырьмя атомами азота в порфирине (плоская структура) является единственным электродонорным атомом в белке, железо обычно находится в пятивалентном состоянии. Когда с ним связываются кислород или монооксид углерода оно становится шестивалентным.